十二月六日下午，南京卫戍司令长官才发现日军迫近了第一线阵地。
由于南京已经成围城，即将变为战场，南京最高层于当晚召集少将以上军官开会，于七日是晨五时四十五分离开南京，飞赴江西，转至武汉统帅部。
最高层在南京时还能够统一指挥为固守南京而紧急增派各个部队。
然而在日军已经完成对南京的合围的时候，最高层才把保卫南京的最高指挥权移交给唐生智。
他在指挥南京保卫战时期，拒绝日军的诱降，坚决表示固守，其抗日表现，无可争辩。
但是，他在南京卫戍部队撤退的问题上，却应负有不可推卸的责任。
为避免南京守军被日军围歼，国军最高层于十二月十一日中午考虑南京守军撤退，遂令顾祝同以电话转告唐生智。
本是要求唐生智当晚渡江北上，令守军相机突围。
唐生智考虑到由自己曾力主固守，若突然先行撤走，怕其后责任难负，因而他要求必须先向守军将领传达清楚最高统帅的意图后方能撤离。
当晚国军最高层亲自致电唐生智，令其可相机撤退。
军令难违，唐生智这才于当夜在卫戍司令部开会研究后，才于十二日撤退。
十二月十二日中午前后，日本侵略者已攻破中华门，南京城中秩序开始陷于混乱。
没有高级将领组织指挥撤退，十数万中国守军瞬间土崩瓦解，南京城完全陷入日本侵略者之手。
在南京失陷前后，国民政府各机关大多忙于政府机关的迁移工作，对于南京城陷后的善后工作以及民众的安全问题并不关注。
国军最高层当时高调表态固守南京，更使得南京市民不可能对战争状态有着正确的估计，他们也不可能有相应的战败后物质与心理准备。
南京失陷前后，大批难民涌入城中的国际安全区，而在此前国民政府对于国际安全区的支持不够，且南京的安全区不像上海的南区难民区一样，它没得到日本方面的承认。
因此，它们对于难民的安全保障和生活救助非常有限。
日军进占南京后，从一九三七年十二月十三日起开始持续了六周的南京大屠杀。
在侵华日军南京大屠杀中，数三十多万的军民屠杀，其中中国军人大概在七至九万人。
如果当时国军真的抱定与南京共存亡，那么何至于这么多的中国军人因没有高级将领的正确指挥而白白牺牲？如果当时的国民政府心中真正装着老百姓，想方设法早日安置他们撤离，何至于这么多的市民无辜惨死？
很多的因素造成了这令人发指的南京大屠杀，而罪魁祸首就是这些已经泯灭人性的日本侵略者。
这些日本人见人就是一个九十度鞠躬的表面假像下，暗藏着一颗巨毒无比的祸心，他们来自一个小小的岛国，却有着野兽般的性格，它们就像暗夜里伺机而动的豺狼，随时都想咬住中国不撒口......
此时岩井公馆内，徐来看着连日来的各大报纸，心情已经跌到了谷底，办公桌前的透明玻璃烟灰缸上堆满了抽完的烟蒂……